Né le 11 janvier 1993 à Bully-les-Mines, Joachim Eickmayer débute le football au RC Lens avant de poursuivre sa formation à l’Olympique Liévin et au Calonne Liévin. Il intègre ensuite le centre de formation du FC Sochaux-Montbéliard, avec lequel il fait ses débuts professionnels en Ligue 1 lors de la saison 2013/2014.
Au fil de sa carrière, il évolue notamment à l’Arras FA, à l’Amiens SC, avec qui il participe à la montée en Ligue 2 en 2016, puis aux Herbiers VF, finalistes de la Coupe de France 2018. Il rejoint ensuite le FC Chambly Oise, contribuant à la montée du club en Ligue 2 en 2019, avant de jouer pour Bourg-en-Bresse Péronnas 01.
À l’été 2023, il s’engage avec le Red Star FC, avec lequel il remporte le championnat de National en 2024 et retrouve la Ligue 2. En janvier 2026, il rejoint le SC Bastia afin de renforcer le milieu de terrain et apporter son expérience dans l’objectif de maintien du club.
